சகோதரி குரோமாடிட் பரிமாற்றங்களை அடையாளம் காணுதல்

சகோதரி குரோமாடிட் பரிமாற்றங்களை வெளிப்படுத்தும் ஒரு கருவியாக ஸ்ட்ராண்ட்-சேக் ஆரம்பத்தில் முன்மொழியப்பட்டது. தனிப்பட்ட கலங்களுக்கு மொழிபெயர்க்கப்பட்ட ஒரு செயலாக இருப்பதால், DNA ஒன்றுக்கு மேற்பட்ட கலங்களின் வரிசைமுறை இந்த விளைவுகளை முற்றிலும் சிதறடிக்கும் மற்றும் SCE நிகழ்வுகள் இல்லாததை பரிந்துரைக்கும். கூடுதலாக, கிளாசிக் ஒற்றை செல் வரிசைமுறை நுட்பங்கள் இந்த நிகழ்வுகளை பன்மடங்கு பெருக்க சார்பு மற்றும் இரட்டை-ஸ்ட்ராண்ட் இணைத்தல் தகவல் காரணமாக காட்ட முடியவில்லை, இதனால் ஸ்ட்ராண்ட்-சேக் தேவைப்படுகிறது. குறிப்பு சீரமைப்பு தகவலைப் பயன்படுத்தி, மரபுவழி வார்ப்புரு இழையின் திசை மாறினால் ஆராய்ச்சியாளர்கள் ஒரு SCE ஐ வெளியிட முடியும்.

தவறாக வழிநடத்தப்பட்ட கான்டிஜ்களை அடையாளம் காணுதல்

குறிப்பு மரபணுக்களில் கணிசமான விகிதங்களில் தவறான திசைதிருப்பல்கள் உள்ளன (எ.கா. சுட்டி குறிப்பு மரபணுவில் 1%). ஸ்ட்ராண்ட்-செக், வழக்கமான வரிசைமுறை முறைகளுக்கு, இந்த தவறான வழிகளைக் கண்டறிய முடியும். தவறான ஓரினச்சேர்க்கைகள் உள்ளன, அங்கு ஸ்ட்ராண்ட் பரம்பரை ஒரு ஹோமோசைகஸ் நிலையிலிருந்து மற்றொன்றுக்கு மாறுகிறது (எ.கா. WW முதல் CC வரை, அல்லது CC முதல் WW வரை). கூடுதலாக, இந்த நிலை மாற்றம் ஒவ்வொரு ஸ்ட்ராண்ட்-சேக் நூலகத்திலும் தெரியும், இது தவறான திசைதிருப்பலின் இருப்பை வலுப்படுத்துகிறது.

படம் 263A | BAIT இன் வெளியீடு, வாட்சன் (W, பச்சை) மற்றும் கிரிக் (சி, நீலம்) இழைகளுக்கான வாசிப்பு எண்ணிக்கையைக் காட்டுகிறது. ஒவ்வொரு வாசிப்பு கணக்கீட்டு பட்டையும் குறிப்பு மரபணுவின் ஒரு குறிப்பிட்ட 200-kb தொட்டியுடன் சீரமைக்கப்பட்ட பகுப்பாய்வுகளின் எண்ணிக்கையைக் காட்டுகிறது. இங்கிருந்து, பெற்றோரின் வார்ப்புரு ஸ்ட்ராண்ட் பரம்பரை ஊகிக்கப்படுகிறது. மகள் கலத்தில் 200-கி.பை. குரோமோசோமால் பிரிவின் இரண்டு பிரதிகள் பெற்றோர் கலத்தில் உள்ள வாட்சன் வார்ப்புரு இழைகளிலிருந்து தொகுக்கப்பட்டிருந்தால், இது ஒரு பெரிய பச்சை பட்டையால் குறிக்கப்படும், அந்த குரோமோசோமால் பகுதியில் முற்றிலும் W சீரமைப்பைக் குறிக்கும். அதேபோல், வார்ப்புரு ஸ்ட்ராண்ட் பரம்பரையின் ஹோமோசைகஸ் மற்றும் ஹீட்டோரோசைகஸ் நிலைகளுக்கு இடையிலான சுவிட்சுகள் சகோதரி குரோமாடிட் பரிமாற்றங்கள் (SCE கள்) என விளக்கப்படுகின்றன. | Maia.smith / Attribution-Share Alike 4.0 International | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Bioinformatic_Analysis_of_Inherited_Templates_(BAIT)_Output.png) from Wikimedia Commons

படம் 263A | BAIT இன் வெளியீடு, வாட்சன் (W, பச்சை) மற்றும் கிரிக் (சி, நீலம்) இழைகளுக்கான வாசிப்பு எண்ணிக்கையைக் காட்டுகிறது. ஒவ்வொரு வாசிப்பு கணக்கீட்டு பட்டையும் குறிப்பு மரபணுவின் ஒரு குறிப்பிட்ட 200-kb தொட்டியுடன் சீரமைக்கப்பட்ட பகுப்பாய்வுகளின் எண்ணிக்கையைக் காட்டுகிறது. இங்கிருந்து, பெற்றோரின் வார்ப்புரு ஸ்ட்ராண்ட் பரம்பரை ஊகிக்கப்படுகிறது. மகள் கலத்தில் 200-கி.பை. குரோமோசோமால் பிரிவின் இரண்டு பிரதிகள் பெற்றோர் கலத்தில் உள்ள வாட்சன் வார்ப்புரு இழைகளிலிருந்து தொகுக்கப்பட்டிருந்தால், இது ஒரு பெரிய பச்சை பட்டையால் குறிக்கப்படும், அந்த குரோமோசோமால் பகுதியில் முற்றிலும் W சீரமைப்பைக் குறிக்கும். அதேபோல், வார்ப்புரு ஸ்ட்ராண்ட் பரம்பரையின் ஹோமோசைகஸ் மற்றும் ஹீட்டோரோசைகஸ் நிலைகளுக்கு இடையிலான சுவிட்சுகள் சகோதரி குரோமாடிட் பரிமாற்றங்கள் (SCE கள்) என விளக்கப்படுகின்றன. | Maia.smith / Attribution-Share Alike 4.0 International | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Bioinformatic_Analysis_of_Inherited_Templates_(BAIT)_Output.png) from Wikimedia Commons

ஆசிரியர் : Yavor Mendel

குறிப்புகள் மற்றும் நூலியல்:

மூலக்கூறு உயிரியல் நுட்பங்கள் II

மூலக்கூறு உயிரியலின் நுட்பங்கள் VI

கருத்துகள்